En el siglo XVI, después de la expedición de Colón, 24 habitantes de Guareña emigraron a América, siendo destacado Domingo de Medina por su conquista en Guazawalco y Honduras, según el trabajo de D. Vicente Navarro del Castillo.
En el siglo XVIII, diversas fuentes históricas proporcionan información relevante, indicando la conexión de Guareña con el Condado de Medellín y el Partido de Trujillo.
En 1720, Felipe V otorga a nuestra población el título de Fiel como reconocimiento por su apoyo en la Guerra de Sucesión. Posteriormente, en 1734, se le concede la independencia del Condado de Medellín mediante Cédula Real.
Queda reflejado la importancia y valía de las armas de Guareña reconocido por diversos monarcas con diferentes títulos para incluirlos en sus armas, el título de Lealtad en el Fuero Real de 1.498 concedido por los Reyes Católicos y el de Fiel concedido por Felipe V en 1.717 tras los sucesos de la guerra de Sucesión.
Un escudo partido. Primero, de azur, león rampante, flambeado y horquillado de oro, empinante a una columna del mismo metal. Segundo, de gules, cruz floronada acompañada arriba y debajo de dos medias lunas reversadas de oro. Al timbre, Corona cerrada.
En 1751, durante el reinado de Fernando VI, se lleva a cabo el Catastro de Ensenada con fines fiscales. En 1791, con la creación de la Real Audiencia en Extremadura, se realiza un Interrogatorio de 57 preguntas para recopilar datos estatales. En ese momento, la villa tenía 2532 habitantes.
Según Tomás López, la tradición cuenta que Guareña tuvo su primera fundación en un cerrillo llamado Cerro de las Chozas o Guarías, donde antiguamente se construyeron chozas o guarías para cultivar la tierra, aunque no hay rastros de ellas en la actualidad.
En el siglo XIX, durante la resistencia contra los franceses, 107 guareñenses se unieron para defender su libertad. Detalles adicionales de esta época se encuentran en el Diccionario Geográfico de Madoz, que describe a Guareña como parte del partido judicial de Don Benito.
Los censos se comienzan a hacer con más regularidad y a partir de 1871 se forman los registros civiles, así en 1850 según Madoz hay 3220 almas y el último del siglo en 1897 nos da 6497 habitantes.
Con el inicio de la Guerra Civil Española, Guareña experimenta una etapa trágica y sangrienta. Está bajo control republicano hasta el 30 de septiembre de 1936, cuando las tropas nacionales toman el control. Durante los años de posguerra, la emigración provoca una notable disminución de la población, reduciéndola de más de 10,000 habitantes a cifras similares a las actuales.